滤材的功用除了在前置过滤中率先滤去一些粒径较大的杂质废物，同时也提供了有利于水晶虾生长的硝化菌一个非常良好的生长环境，饲养者在设缸后应即时添加去毒活菌酵素及神奇宝贝全效科技硝化活菌以快速建立稳定生态系统。约一周后，再导入水晶虾。
　　好的滤材搭配是过滤品质成败的主要关键，建议玩家选用活性生物过滤滤材，藉由高透气性、多孔结构的滤材来培养大量各种硝化益菌等良性益菌，形成一个可以处理水质废物的生物菌群，如：行家首选生物着床滤材、神奇宝贝的全效科技硝化活菌、石英活菌环或陶瓷环等，主要目的是利用这类滤材所提供的大量表面积去附着对维持水质稳定有利的微生物，并进一步分解水中的含氮废物、亚硝酸、氨等进行生物过滤，是饲养水晶虾时会大量使用到的滤材。但需注意前置过滤棉的使用或是额外准备前置过滤桶，即可延长生物滤材的使用寿命。
值得一提的是：行家首选滤材有别于一般的生物性滤材，含有特殊活菌、净水菌及吸除亚硝酸氨等特殊物质，能营造最佳的过滤质量，并将活菌大量附着在滤材之上，使质量极佳的滤材发挥快又好的过滤及培菌功能；相对的，如果消费者选择不当的滤材，不但会折损过滤器的功能，从而影响饲养缸的水质以及生物过滤系统的建立，更容易因此造成生态失衡滋生藻类等问题。