昆明市石林县的车牌号是云A打头的，云A是云南省的机动车号牌编码，表示该车辆在云南省注册。根据云南省机动车号牌管理办法规定，昆明市的车牌号码以云A开头，其后两位数字表示车辆所属地的行政区划代码，例如昆明市对应的行政区划代码是01。