厦门医学院共开设七个本科专业，包括临床医学、口腔医学、预防医学、中西医结合、护理学、医学技术管理及卫生事业管理等。临床医学专业重点培养具备领悟、分析、解决当代医学发展中实际问题能力的临床医师，他们能在西医学临床工作中，具有良好的医学理论知识和独立诊治能力。口腔医学专业侧重口腔医学临床和口腔保健领域的研究，培养具有先进的临床理论知识与临床技术、独立承担临床工作能力的专业人才。