实验二小已在北京及外省市设立分校9所。不同于以往的分校，实验二小朝阳分校是一所“捆绑式分校”，由本校直接参与管理，在办学理念、课程设置等都将与本校保持一致，如本校开设的京剧、舞蹈、综合学习课程等都将在朝阳学校开设，实现优质教育资源的扩大辐射与输出。朝阳分校成立后，实验二小将选派一位副校长到朝阳学校担任校长，并派多位管理干部和骨干教师进驻。朝阳学校的教师属于朝阳区教委编制，但由实验二小参与管理。