在生化危机1代里，安布雷拉公司开发的B.O.W生体兵器Tyrant（暴君）基本失败了，虽然“杀掉”了威斯克（其实这只是威老大的计划之一，为了掩人耳目）,但是却被S.T.A.R.S的克里斯和吉尔打倒，使得Tyrant在公司高层的评价大幅下降。 

接着，死而复生的水蛭人马库斯博士为了向公司和威廉博士报复而暗中破坏，T病毒初步泄露，丧尸开始从莱肯市郊外和阿克雷山区出现。马库斯博士被瑞贝卡和比利消灭后，安布雷拉公司派遣特殊部队U.B.C.S抢夺G病毒并企图杀死威廉博士，威廉不得已给自己注射了“G-virus”而变异为怪物“G”，G释放了实验室大量病毒，包括始祖病毒，T病毒和G病毒。这些病毒被下水道的老鼠带往城市各处，至此，生化危机全面爆发。 

生化危机3代和2代发生在同一时间（3代前半部发生在2代前，后半部则是2代后，时间跨度比2代更大），所以从理论上来说，吉尔是有可能遇到里昂和克莱尔的（虽然游戏里并没有遇到）。安布雷拉公司意识到事情的严重性，派遣佣兵部队对抗丧尸拯救市民（其实是暗中搜集战斗数据），同时空投六具Tyrant到莱肯市内。不想为了抢夺病毒样本，美国政府军也同时开进莱肯市。但是危机如此可怕，美军仓促消灭六具Tyrant后慌忙撤退。安布雷拉公司只得将B.O.W的下一代生体兵器Nemesis（复仇女神）投入市内，目的是将幸存的S.T.A.R.S成员全部灭口，所以我们就看到了穿蓝背带裤，拿火箭筒，总是吼叫着“S.T.A.R.S”的帅哥——追踪者。 
所以，复仇女神指的就是追踪者，某种意义上是三代的真正主角。