史书上说，舒尔哈齐出使明朝回到故里后，一时为大明京城的万井笙歌、一樽风月所迷惑，“中国(明朝)宣谕，无不听命”。政治老手努尔哈赤必须处理政治立场开始动摇的弟弟舒尔哈齐，舒尔哈齐的政治生命就走到了尽头。
万历二十七年(1599年)，努尔哈赤兄弟合兵出征哈达女真部。哈达兵出城搦战。舒尔哈齐用兵布阵的动作稍有迟疑，努尔哈赤则立即在全军将士的公开场合，铁青着脸，厉声斥责舒尔哈齐：“带着你的兵冲上去！不要往后面退缩！”
如此，满面赧色的舒尔哈齐，只好冒着城头如雨的箭矢，不顾一切地往上仰攻。后来虽然把城攻下了，但军中的伤亡却很多。这是努尔哈赤首次在临敌的状态下，打击与自己齐名的舒尔哈齐的威信。这对于舒尔哈齐而言，已然是一种不祥的预兆了。
后来的乌碣岩一战成就了褚英最初的英名，却令英名一世的舒尔哈齐背上了畏敌怯战的骂名。
当时，建州女真的子弟兵中约有三分之一多的将士曾归舒尔哈齐统领。
努尔哈赤没有急于立即打击舒尔哈齐，而是不动声色地提出：把舒尔哈齐平时最得力的两员大将常书、纳齐布处死。这就逼着主将舒尔哈齐厚着脸皮向努尔哈赤恳求：“若杀二将，即杀我也！”
努尔哈赤提出要赦免二将的死罪也不难，前提是胞弟舒尔哈齐暂时离开队伍休养一段时间，这就顺势削夺了舒尔哈齐的兵权。
