内部分类
睡莲属中的种类与类型繁多，被接受的物种约有50个左右，分属于五个亚属[1]。
澳洲睡莲亚属 Anecphya[2]
N. alexii
N. atrans
N. carpentariae
N. elleniae
N. georginae
N. gigantea
N. hastifolia
N. immutabilis
N. macrosperma
N. ondinea
N. violacea
广热带睡莲亚属 Brachyceras[3]
N. ampla
南非蓝睡莲 N. capensis
N. colorata
N. divaricata
N. elegans
N. gracilis
N. guineensis
N. heudelotii
N. micrantha
N. minuta
延药睡莲 N. nouchali
N. ovalifolia
N. pulchella
N. stuhlmannii
N. sulphurea
侏儒卢旺达睡莲 N. thermarum
N. togoensis
新热带睡莲亚属 Hydrocallis[4]
N. amazonum
N. belophylla
N. conardii
N. gardneriana
N. glandulifera
N. lasiophylla
N. lingulata
N. oxypetala
N. jamesoniana
N. novogranatensis
N. potamophila
N. prolifera
N. rudgeana
N. tenerinervia
古热带睡莲亚属 Lotos[5]
齿叶睡莲 N. lotus
N. petersiana
柔毛睡莲 N. pubescens
红花睡莲 N. rubra
北温带睡莲亚属 Nymphaea（Castalia） [6]
组 Chamaenymphaea[7]
睡莲 N. tetragona
N. leibergii
N. pygmaea
组 Nymphaea(Eucastalia)[8]
白睡莲 N. alba
雪白睡莲 N. candida
香睡莲 N. odorata
黄睡莲组 Xanthantha[9]
黄睡莲 N. mexicana
杂交种
常有属内杂交出现，部份杂交种如下：
N. ×borealis
N. ×cultorum
N. ×daubenyana
N. ×eburnea
N. ×helvola
N. ×laydekeri
N. ×marliacea
N. ×ortgiesiana
N. ×thiona