矛盾之处：
脱氮和除磷是相互影响的。脱氮要求较低负荷和较长泥龄，除磷却要求较高负荷和较短泥龄。脱氮要求有较多硝酸盐供反硝化，而硝酸盐不利于除磷。设计生物反应池各区（池）容积时，应根据氮、磷的排放标准等要求，寻找合适的平衡点。
为什么同步脱氮除磷无法同时达到较好效果：
脱氮除磷对泥龄的要求是不同的：脱氮过程中硝化细菌在反应器中存活幵维持一定的数量，微生物在反应器中的停留时间，必须大于硝化菌的最小世代时间，通常要有10-25d，脱氮率才不受泥龄的影响。有人考察了泥龄与除磷的效果关系，当污泥龄从30d降到5d时，脱磷率从40%上升到87%，是泥龄过长，聚磷菌已吸收的磷又重新进入液相的缘故。一般建议以脱磷为主要目的的系统的泥龄宜控制在3.5-7d。