2011年1月，退役后的李金羽接受中国女子国家足球队主教练李霄鹏的邀请，成为中国女足的助理教练，中国女足在2012年伦敦奥运会足球预选赛中被淘汰，历史上首次无缘奥运会。
2012年1月9日，李金羽成为山东鲁能泰山足球俱乐部竞训部副经理和球队副领队，2012鲁能惊险保级，创历史最差。
2016年1月22日消息，石家庄永昌宣布国家队助理教练、前中超射手王李金羽加盟，他将担任俱乐部副总经理兼技术总监，2016石家庄永昌降级。
2017出任苏宁体育的副总一职，然后