近年来，随着国家《食用农产品市场销售质量安全监督管理办法》等法规的出台，政府对农产品质量安全日趋关注，各类市场的农产品质量安全问题已经发展成为工商和市场监管部门在综合执法改革后的监管重点。尤其是农贸市场，作为和百姓餐桌联系最密切的“菜篮子”，农贸市场首当其冲的成为了监管的重中之重。
但事实上，对于农贸市场来说，食品安全监管是很复杂的，由于商户摊贩的参差不齐，售卖种类的多种多样，以及农贸市场本身的落后设施条件，都间接导致了农贸市场成为了很多食品安全问题滋生的“沃土”。
农贸市场种类多，环节复杂，可追溯性难操作
就比如农贸市场里肉类食品和蔬菜类植物性食品，两者的食品安全追溯就不同，实现环节也有所侧重。首先农贸市场肉类食品基本都是规模化生产，而且多数工厂都形成了产业链条，提供的肉食品都是经过深加工或初加工之后进入市场的，在质量检测追溯方面是完全可控的。肉类食品中从生猪、活鸡到成品肉，经过养殖场到屠宰场再到批发市场或农贸市场、超市等环节，在追溯方面也比较容易，像成品猪肉，都有检疫章或成品单号，方便追溯查询。
但对于农贸市场蔬菜类的植物性食品来说，在追溯方面则相对比较复杂。由于先天性的小农经济、产销地分离等因素影响，导致我国很多农产品很难规模化生产。而且最为重要一点则是农产品在流通中的分散性十分明显。一般流通环节是由固定经销商从产地或大棚（种植大户）运输，进入批发市场，再从批发市场到农贸市场、超市、菜市场等分流发散出去，再有一些当地自种农民（小散单位）自由贩卖等，源头供应商繁多、供应环节复杂，导致农贸市场的蔬菜类食品追溯起来很难。此外，蔬菜类食品追溯还有一个难题，就是由于大多农贸市场蔬菜批量较大，它很难像猪肉那样实现在每一株蔬菜上做出标签或标码。这也一定程度上，导致农贸市场蔬菜类食品很难追溯，只能单纯地依靠经验和诚信维护，但是结果有很大的不确定性。
农贸市场缺乏可视化、有效的追溯数据支撑
最后，整个农贸市场食品安全追溯缺乏有利的数据支撑，无论是流通数据、交易数据、监测数据，还是商户信息、市场信息、菜品信息等，市场其实都有，但是缺乏一个集中的数据平台整理、记录。导致整个农贸市场没有可视化的数据，这也一定程度上导致了农贸市场想实现食品安全追溯很难。无据可查，也无据可依，更无据可究。
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