1.钢舞姬是外星邪神科技，被少数野心家获得秘密研发超级战士钢舞姬企图征服世界。结果实验失败，钢舞姬兽化，病毒扩散导致世界毁灭。（战车兽也会传染动物，类似于伊藤润二的《鱼》）但他们却掩盖了真相，用死水和黑水两大组织把控世界秩序，继续秘密进行钢舞姬研究。（外神）旅行者发现了地球的异常来灭火。

2.不知情的主角不知道隆美尔，蒙哥马利正是当年研究计划的主导者之一，傻傻与旅行者战斗。钢舞姬需要消耗人性来发挥武装的力量，人性消耗殆尽就会野兽化便乘战车兽。吸食战车兽的血能恢复部分人性，但是仍然有大量钢舞姬继续兽化。
3.（外神）旅行者是高维度生命，来地球需要先头部队布兰达制作义体降临 。地球上发生的一切其实这是古神的阴谋，数万年前旅行者将它封印于地底。为了摆脱束缚，它让隆美尔SAN值掉了，并把外星舞装交给隆美尔。疯掉的隆美尔于是实行钢舞姬计划，其实是为了帮助古神解除封印回到地面。旅行者来地球是为了解决掉古神引起的麻烦。
4.故事最后古神计划成功了，在吸收了无数少女的人性后，终于能突破束缚。从隆美尔身上伸出无数触手重返地面，并融合无数战车兽，变成了的古神本来面目————极其丑恶的怪物，开始毁灭世界。
5.面对强大的敌人主角团根本无还手之力，佐伊一人独自面对boss却被触手抓住。古神叫嚣：只要吸收了你我就天能变成完全体统治地球，没有人能打败我了！哈哈哈哈！
6.佐伊即将被碾碎之时，突然觉醒，恢复了所有的记忆。原来她也是旅行者，是当年旅行者留在地球球上的看守者，是封印古神的唯一钥匙。旅行者来地球就是为了让她觉醒。
7.佐伊便乘成和旅行者一样的高维生物。旅行者也脱离义体，把义体化为时空因果律形apds脱壳穿甲弹进入佐伊的炮膛。佐伊一炮终结了所有悲剧的根源。所有死去的少女都获得了救赎，钢舞姬和兽化的少女都变回了人类。
7.佐伊也不适合留在地球，和旅行者们一起离开了地球。并把红蝴蝶结结留给男主，说不要想念她。