菊苗的打顶（摘心）非常重要。打顶有三个作用：一是矮化，二是促进根系长旺，三是使菊苗长壮。
打顶的方法有二。一是矮一点的苗，留4，5片叶，把顶端摘去，或剪掉。不久后下部会发几个腋芽，留最下面2至3个芽就行了，其余抹掉。此后反复打顶摘心，控制长高。在立秋前几天，确定所留枝条数，其余的抹掉。二是高一点的苗，摘去顶端，让下面叶腋发芽，然后抹掉上面的芽，留最下面2至3个芽。芽长至8片叶左右时，剪去主枝即可。此后反复打顶摘心，立秋前定头，此亦称翻芽法。
打顶后最好留土上面的芽。从土里发出的芽，可能不开花。