由于肛门位置特殊，对该部位的湿疹常采用联合疗法，通常是抗组胺药物与局部外用药合用，物理疗法还有激光、局部氧疗、紫外线红外线疗法等。
如果药物治疗、物理治疗等保守治疗都难以有效解决患者痛苦，可以尝试手术治疗，如肛周皮肤皮下分离、肛周皮肤切除缝合等。