马加爵为什么要杀掉四个同学，原因一直众说纷纭，官方说法如下：
邵瑞杰:马加爵大学三年半最好的朋友，因为打牌于马加爵发生口角，批评了马加爵的为人，于是被杀。
马加爵供述：“我跟邵瑞杰很好，邵还说我为人不好。我们那么多年住在一起，我把邵当作朋友，真心的朋友也不多。想不到他们这样说我的为人。我很绝望，我在云南大学一个朋友也没有……我把他当朋友，他这么说我，我就恨他们。”
唐学李：不是马加爵的舍友，也并没有在邵瑞杰和马加爵的夺命牌局中争吵，更不曾和马加爵有任何过节。在唐学李女友看来，二人甚至算是不错的朋友，唐平时喊马加爵“马哥”，从来没有言语不慎得罪马加爵，只因为他暂时借住在马加爵宿舍里，妨碍了马加爵的杀人计划，因而被杀。
马加爵供认为什么第一个杀唐时说：“不是先后的问题，而是下手的机会来了，他恰好那时在寝室。如果是别人，结果也会一样。”
龚博：和马加爵从来没有冲突，来往不多，按照马加爵的解释是因为过生日没请马加爵，而邵瑞杰又用此事教训马加爵：“就是因为你人品不好，所以龚博过生日都没叫你”因而被马加爵怀恨，惨遭杀害。
杨开红：马加爵正在宿舍里处理杀死邵瑞杰时留下的血迹时，恰巧来到马加爵的宿舍找人，马加爵担心事情泄露，杀害了杨开红。