胎盘、脐带间充质干细胞，主要指的是从新生儿胎盘或脐带组织中提取的一种多能干细胞。它们不会被机体的免疫系统识别，同时，还有其它一些免疫相关分子不表达或低表达使得间充质干细胞可以逃避机体免疫系统的识别，避开宿主监视，因而输注到体内不会引发很强的排斥反应。

加之胎盘和脐带在发育上非常原始，其来源的间充质干细胞具有很强的免疫调节作用，可以抑制机体亢进的免疫反应，从而防止过度免疫应答可能对宿主组织造成的损伤，这一特性也使得间充质干细胞在自体免疫疾病的治疗上拥有着极为广阔的前景。目前，临床上已经有应用脐带来源的间充质干细胞联合HLA半相合的造血干细胞进行共移植治疗重型再生障碍性贫血，结果发现可以明显降低并发症的发病率，加快造血重建，且降低GVHD（移植物抗宿主病）发生的风险，提高了移植存活率。
综上，间充质干细胞因其低免疫原性不免疫调节功能，突破了脐血或骨髓来源的造血干细胞在移植时因配型要求严格而对供者来源的限制，所以在临床上使用它们无需进行配型。