可能会立案。一般情况下,当债权人或者其合法代理人向人民法院提起诉讼时,人民法院将依法受理,而如果是未满十八岁的未成年人违约、未取得完全民事行为能力人有关债务的案件,人民法院根据《中华人民共和国民法通则》将不予受理。5000元属于小额债权,一般情况应予受理,虽然也可能因为一些特殊情况或者涉及法律和程序,而导致不予受理。依据《中华人民共和国民法通则》及其相关法规,5000元属于小额债权,一般情况应予受理,但各个地区法院执行受理标准可能会有差异,由案件是否受理最终要看当地法院所采取的执行措施。当双方所签订的借款协议涉及法律条文,或者违反了甲乙双方所认可的当地法律,此类借款可能无法立案并寻求司法救济,此外,涉及到利息等内容也有可能构成法律上的违约行为,仍然可能影响借款案件的受理。