不属于高新区。因为温州市的高新技术产业开发区被划分为南温和北温两大政策性区域，而丘头镇位于温州市苍南县，不在这两大区域之内。此外，温州市高新技术产业开发区是中国重要的制造业和现代服务业集聚区，拥有航空航天、新材料、生物医药、节能环保、新能源、电子信息等六大优势产业专区和多家高新企业，也可以说是温州最具前景的经济发展区域。