小马遇到的困难是河里有太多的水，它不知道如何过去。古时候，河里的水很深，河面宽而平坦，所以无法游泳牵引小马过去。另外，浊流还会使小马摇摆不定，更加增加了小马过河的难度。因此，小马遇到的困难就是如何才能安全地过河。