洪荒大劫篇：主线副本，出现在第3X关（X=1~12），大部分只有一条命，没什么特别的技能，击败祖巫后可获取饰品装备。
上古天帝篇：世界BOSS副本，BOSS等级为24+6X（X=1~12）级，技能较强，半血后立刻无敌，并且释放技能，造成无视护盾全屏100%生命上限的伤害，击败祖巫后可获取祖巫精魄，提升战斗力。
造梦无双：主线副本，出现在第75+5X关（X=1~12），BOSS等级为150+10X（X=1~12）级，属性、技能和其威力一般，祖巫被击败后复活，复活后属性、技能和其威力变强，击败复活后的祖巫后即可彻底胜利，可获取增加攻击+魔法属性护腕装备。
冷知识：《十二祖巫》出自小说《佛本是道》，其祖巫的原名是：
金之祖巫=蓐收、木之祖巫=句芒、水之祖巫=共工、火之祖巫=祝融、土之祖巫=后土。
风之祖巫=天吴、雨之祖巫=玄冥、雷之祖巫=强良、电之祖巫=翕兹。
天气祖巫=奢比尸、空间祖巫=帝江、时间祖巫=烛九阴。