在天结神缘1里，主角团们击败了神级存在，仅凭5级的实力肯定是做不到的。所以应该继承过去的实力（载入通关存档），以50级的实力开局才是合理的。此时，菲娅已晋升成现神，并掌握了二品神心:结缘神心，伙伴们也都进阶成了掌握高品真意的超凡生命。故事的走向也应该是这样发展的：
第二部的舞台从物质界来到了黑暗深渊，黑暗深渊发生了异变，影响到了物质界，所以男主和菲娅以及新生的女儿库娜前去解决异变。黑暗深渊是以魔术师修行体系为基础生存法则的世界，人情冷暖淡泊，对待平民非常残酷。于是，一位诞生于黑暗深渊的魔法少女想要改变这冷漠的秩序，所以她和反派合作，想要唤醒一位沉睡着的掌握一品神心“世界神心”的大魔神。
而这时主角团介入，想要阻止魔法少女吸收大地能量的计划，魔法少女虽然是能够越阶挑战的超凡生命，但面对掌握二品神心的神级强者菲娅，还是节节败退。主角团们以摧枯拉朽之势破坏了魔法少女在黑暗深渊各处设置的法阵，并借鉴黑暗深渊的魔术师修行体系来强化自身的实力。可谁曾想，与魔法少女合作的反派坐山观虎斗，使用借刀杀人之计，将魔法少女恶堕，并设法唤醒了大魔神。
反派以恶堕的魔法少女为宿体，让大魔神附身。大魔神掌握的一品神心威能比菲娅掌握的二品神心强多了，菲娅一时难以抵挡。还好女儿库娜临阵突破，掌握了一品真意雏形:极点真意雏形。极点，乃一切的开始，一切的终结，能够吸收所有属性的能量。库娜借助界神器“库娜城砦”，并吸收众人的魔力，发挥出了极点神心的威能，击破大魔神以世界神心为基础构造的界神器法阵。
而后主角团进入了大魔神的界神器内部，与大魔神宿体决战。虽然大魔神掌握一品神心，但在由于只是宿体降临并非本尊，仅能使出半神极限的威能。在诸多掌握二品真意的超凡生命围攻之下，大魔神败退，魔法少女意识回归本尊，危机解除了。
通过这场危机，主角团的实力也大为精进，并用这次作战的功劳赦免了魔法少女，让魔法少女在黑暗深渊建立安全区，今后永远庇护落难的平民。而库娜掌握一品真意雏形后，可以随意操控“库娜城砦”行走于各国，天下再也没有人能阻挡主角团的前进了。
破军歌姬
，z里薄纱慈悲女神，脚踢各路魔神，v开头差点打不过小boss
